应用简介
核酸和蛋白质是组成生命的主要生物大分子,两者的相互作用是构成生命活动的生长、繁殖、运动、遗传和代谢等生命活动的基础。研究蛋白质和核酸间的相互作用是人们探索生命现象奥秘的关键,CHIP检测实验是应用于蛋白与核酸互作关系的重要参考。
技术原理
CHIP实验在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。
实验方法
技术总结
1、细胞样本所需数量较大,需要提前按照所需细胞的要求整理,保证细胞所需量达到要求。
2、染色质消化过程需要调整,以获得更好的消化时间,需要进行相关梯度摸索。
3、不同细胞的处理时间和细胞数目会有差异,需要进行调整。
4、部分抗体级别可能达不到CHIP级别的要求,需要采购对应级别的抗体并通过阴阳性实验反馈结果可信性。部分特异染色质检测靶序列可能无法在一次扩增中获得较好的结果,需要不断调整引物。