做笔记的过程就是一个很好的学习过程。
第一步
根据deg-lnc 和 mircode ，构建deg-lnc和mir的关系，得到文件lncRNA_mircode文件
第二步
根据第一步得到的lncRNA_mircode和deg-mir，构建deg-mir和lncRNA的关系，得到lncRNA_miRNA文件
第三步
根据deg-mir和starbase_miRNA文件，得到标准化以后的miRNA,即文件miRNA
第四步
根据标准化以后的miRNA文件，使用数据库miRDB/miRTarBase/TargetScan三个数据库预测靶基因，并求交集，得到文件result.xls
第五步
根据degmRNA和targetmRNA，求交集，得到共同表达的mRNA文件，即deg-mRNA
第六步
根据交集得到的deg-mrna文件和miRNA-Target文件，得到deg-mRNA与miRNA的关系文件，即miRNA-mRNA文件
第七步
根据得到的lncRNA-miRNA文件和miRNA-mRNA文件，合并之
第八步
构建ceRNA网络，根据上述得到的lncRNA-miRNA-mRNA文件，连同分类及regulation，构建特征文件,cytoscape可视化ceRNAnet
所需要的文件
不变的：
1. mircode.txt 构建lnc和miRNA的关系
2. starBase_miRNA.txt 标准化miRNA
变的：
1. deg-miRNA、deg-lncRNA、deg-mRNA
2.deg-miRNA的预测靶基因 三个tsv文件
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